Een andere manier om de oorzaken van diarree en ook andere spijsverteringsziekten op te sporen, is een endoscopie. Ook hier is het uitzonderlijk dat een arts dit onderzoek al op de eerste consultatie aanvraagt. Als de endoscopie wordt uitgevoerd om de binnenkant van het colon te bekijken, spreken we van een coloscopie of video-colonoscopie.
Hierbij wordt via de anus een soepele optische slang ingebracht, waarmee de binnenkant van de darm visueel kan worden onderzocht. Dit onderzoek wordt uitgevoerd door een gastro-enteroloog. Het gebeurt meestal in een dagkliniek en vereist een bepaalde voorbereiding. De voorbereiding bestaat uit een dieet in de dagen voorafgaand aan het onderzoek en het innemen van een middel dat de ‘reiniging’ van de darmen bevordert, zodat de arts de darmen goed kan visualiseren. In de meeste gevallen gebeurt een endoscopie onder verdoving met het oog op het comfort van de persoon die moet worden onderzocht. Naargelang de situatie duurt het onderzoek een half uur tot een uur. Als de arts het nodig vindt, zal hij tijdens de endoscopie een klein stukje van de darmwand wegnemen en het laten analyseren onder de microscoop. Dit kleine stukje wordt een biopsie genoemd. U kunt na het onderzoek en op voorwaarde dat iemand u vergezelt, weer naar huis zodra u weer goed wakker bent.